По юго-западной окраине района протекает река Белая, по восточной — река Уфа с притоками Уса и Изяк. В долинах рек, особенно Белой, немало пойменных озёр.
Река Зея рассекает территорию района на две неравные части - высокую равнину и высокую пойму рек Зеи и Амура. В долине Зеи - болота кустарники, сенокосные угодья. Средняя температура января - минус 27,4 градуса, июля - плюс 20,4 градуса. Осадков выпадает в год до 570 мм

Реки -Амур с притоками Гуран, Манчьжурка, Грязнушка, Симониха и Зея с притоками Безымянка и Прядченка.