В Теплостанском лесу есть участки с преобладанием самых разных деревьев (ели, березы, осины и даже вяза), но больше всего лип и дубов.

На многих участках заказника находятся вторичные леса: березняки, выросшие на бывших пашнях. В настоящее время идет естественный процесс постепенной замены берез липами. Хвойных лесов в заказнике практически нет, если не брать в расчет эффектный сосняк в его западной части. Почва суглинистая, богатая, и хвойные породы (особенно сосна) быстро вытесняются широколиственными деревьями. В сырых местах, на более бедной почве, обычны древесные (ракита, ветла) и кустарниковые виды ив, а также серая ольха.

Сейчас Тропарево сильно облагородили – оно стало очень цивилизованным местом для отдыха. На территории зоны отдыха разместили различные аттракционы для детей: прямо на территории пляжа есть детские площадки и карусели, летом открывают дополнительные аттракционы и батут, а также летнюю сцену, где проходят эстрадные выступления. Для занятий спортом тут есть специальные площадки с волейбольной сеткой. На пляже – душевые кабинки и кабинки для переодевания. Для детей и не умеющих плавать открыта купальня. В центре парка расположен большой пруд с лодочной станцией, где дают на прокат лодки и водные велосипеды.

Родник «Холодный»
Расположен в Тропаревском лесопарке. Вода этого лесного ручья была освящена, а потому считается святой.

Большой пруд
В районе зоны отдыха на Очаковке устроен большой пруд, созданный в послевоенное время.

Кукринский ручей
Кукринский ручей – наиболее естественный и хорошо сохранившийся водоток Теплостанского леса. Как и Очаковка, он впадает в Тропаревский пруд. До второй половины 1970–х гг. в его начале существовал пруд, зарастающий котлован которого уцелел недалеко от родника Холодного.



Курганные группы
На территории заказника сохранился ряд памятников археологии. Это курганные группы ХI–ХIII вв. – древние славянские кладбища. В лесопарке их четыре. Все они расположены по правому и левому берегам Кукринского ручья неподалеку от родника. Курганные группы достаточно большие. Они насчитывают около 50 курганов, расположенных в шахматном порядке. Одна из курганных групп, носящая условное название «2-я Коньковская», была раскопана в 1958 г. экспедицией Музея истории и реконструкции Москвы.