Горная часть и прилегающая к ней равнина имеют густую и сильно разветвленную речную сеть. Почти все реки республики носят ярко выраженный горный характер и берут начало на высоких гребнях хребтов из родников и ледников. Крупные реки - Терек, Асса, Сунжа, Армхи.
Республика входит в число регионов с наиболее интенсивным загрязнением сточными водами.
Водозабор из подземных источников осуществляют 72 водопользователя, в том числе 45, имеющих разрешение на спецводопользование.