Основные реки района: Амгунь и её притоки — Нимелен, Нилан, Семи, Ольджикан, Уда, Сомни. Амгунь судоходная от устья до села имени Полины Осипенко. Озёр всего около четырёх тысяч, крупнейшие — Чукчагирское (366 км²), Джевдоха (19 км²).

Амгу́нь (эвенк.: Амӈун; нивх.: Ӽыӈгр) — река в Хабаровском крае, левый приток Амура, образована слиянием рек Сулук (Суду, Холук) и Аякит на склонах Буреинского хребта.

Длина — 723 км, площадь бассейна — 55,5 тыс. км². В бассейне реки около 2,5 тыс. озёр суммарной площадью 647 км². Средний расход воды у с. Гута 489 м3/с.

Течёт по заболоченной тайге, по вечной мерзлоте. Преобладающее питание дождевое. Главный приток — Нимелен.

Амгунь в верховьях - типичная горная река. В нижнем течении (ниже с. Осипенко) она приобретает черты равнинного потока. Судоходна на 330 км от Амура. Река богата рыбными ресурсами, среди которых выделяются осётр, кета и горбуша.

Вдоль Амгуни до посёлка Берёзовый протянулась трасса Байкало-Амурской магистрали.

Устье река Амур
Длина 723 км
Площадь бассейна 55 500 км²
Расход воды 600 [1] м³/с

Нимелен, река в Хабаровском крае РФ, левый приток р. Амгунь (бассейн нижнего Амура). Длина 311 км, площадь бассейна 14 100 км2. Берёт начало в хребте Ям-Алинь. Питание преимущественно дождевое; половодье с мая по сентябрь. Средний расход воды в 41 км от устья 118 м3/сек.

Нилян, Нилен — река Приморской области, истоки в предгорьях Буреинского кряжа, левый приток Амгуни. Длина около 70 верст. Долина реки узка и обставлена горами, покрытыми хвойным лесом.

Река Ольджикан (Ольгин) впадает в реку Амгунь. Питание снеговое, дождевое и грунтовое. Ледостав с конца октября - начала ноября до мая.

Уда — река протекающая в Хабаровском крае впадает в Удскую губу Охотского моря.

В устье расположен порт Чумикан.

Длина водотока реки — 457 км, площадь бассейна 61,3 тыс. км², средний расход воды около 800 м³/с. Исток на северном склоне хребта Джагды.

Река является местом нереста лососёвых пород рыб.

Чукчаги́рское о́зеро — крупное пресноводное озеро в районе имени Полины Осипенко Хабаровского края в бассейне реки Амгунь. Глубина до 6 метров. Площадь зеркала 366 км², с островами — 386 км². Много высоких (более 50 м) лесистых островов, есть также плавучие острова - сплавни. Два крупных острова (Джалу и Годбаньки) разделяют озера на три плёса. Берега извилистые, в северной части низкие болотистые. На северо-восточном берегу посёлок Чукчагир. Вытекающая река Ольджикан (Ольгин) впадает в реку Амгунь. Питание снеговое, дождевое и грунтовое. Ледостав с конца октября - начала ноября до мая.