На территории Бирилюсского района находится разветвленная водная сеть с множеством рек и озер. Протекает много рек, самые крупные из которых Чулым и её приток Кемчуг. Они судоходные (для мелководных судов) в течение летних трех месяцев.

Обе реки представляют собой уникальные маршруты для водного туризма. Протекая по одной территории, они совершенно различны по своему характеру, по тому комплексу незабываемых ощущений, которым нельзя не восхищаться, сплавляясь по этим рекам в летне-осенний период.

Реки Бирилюсского района:
Базаровка (приток Конды)
Берёзовая (приток Мендели)
Большая (приток Мендели)
Выя (приток Мендели)
Еловая (приток Кети)
Еловик (приток Еловой)
Кандат (приток Чети)
Кичиг
Кичуль
Колтусоватка
Конда (приток Малой Кети)
Красноярка (приток Малой Кети)
Кузина (приток реки Мендель)
Кулган
Кытат
Листвянка (приток Малой Кети)
Малая Кеть
Мендель (приток реки Кеть)
Налимка (приток Мендели)
Нижняя (приток Мендели)
Ольховка (верхний приток Малой Кети)
Поперечная (приток Мендели)
Сосновка (приток Малой Кети)
Сохатинка (приток Нижней)
Суразовка
Сухая Речка (приток Малой Кети)
Тюхтет (приток Чулыма)
Чайголь
Чёрная (приток Мендели)
Чиндат (приток Чулыма)
Ярбуш

На территории Бирилюсского района находится множество озер и стариц в болотистых и таежных местах, их более 70. Известные озера Шаман и Ира.

Реки и озера интересны для любителей рыбного лова. В водоемах обитают: осетр, стерлядь, нельма, судак, щука, окунь, лещ, язь, пескарь, елец, ерш, налим.