Поверхностные воды
Основная водная артерия Пожарского района – река Бикин, самый крупный приток реки Уссури. В пределах района протекает на протяжении 300 км, наибольшая ширина в нижнем течении - 200 м.

Общая длина реки 560 км, площадь бассейна 22,3 тыс. км², общее падение реки 1334 м, средний уклон 2,4 ‰. Притоки Бикина: самый длинный из них - река Алчан (150км), затем Зева, Светловодная, Ключевая и др.

Реки Пожарского района: Алчан (приток Бикина), Бикин, Большая Сахалинка, Контровод, Улитка (приток Алчана), Уссури.

Контровод — река на Дальнем Востоке. Протяженность реки - 49 км. Интересной особенностью реки является изменение её русла с периодичностью в три месяца: она впадает то в реку Уссури (приток Амура), то в реку Бикин (приток Уссури). На реке расположено водохранилище Приморской ГРЭС.
На реке расположен посёлок городского типа Лучегорск, центр Пожарского района, находящийся в 9 км к востоку от одноимённой железнодорожной станции.

Река Контровод - приток Бикина - имеет рыбохозяйственное назначение. Когда водохранилища не было, река в зависимости от того, сколько было в Бикине воды, либо втекала в него, либо вытекала, оттого и получила свое название.

При строительстве Приморской ГРЭС на реке Контровод образовано Лучегорское водохранилище. Длина его составляет около 4 км, ширина — около 2 км. В Лучегорское водохранилище впадает несколько мелких рек и ручьёв, водохранилище соединено каналом (для подвода воды) с охлаждающими устройствами Приморской ГРЭС.

На территории Пожарского район находится 17 озёр. Располагаются преимущественно в пределах низменностей. Они имеют старичное происхождение. Наибольшее их количество расположено по долинам рек Бикина и Алчана. Наибольшая глубина озёр до 8 метров, наибольшая протяжённость до 2 км. Общая площадь озёр 1400 га.

Спондинское озеро находится на правом берегу реки Бикин, рядом с автотрассой В.Перевал - Федосьевка. Его площадь 1,4 га, глубина 2,5м. Здесь произрастают эвриала устрашающая и водяной орех, занесённые в Красную книгу.

Болота в районе не имеют ландшафтообразующее значение. Основная часть расположена на низменностях, в долине реки Бикин. Наиболее распространен кустарничково - моховой тип болот.

Подземные воды
Пожарский район относится к Северо - Приморской гидрологической провинции подземных пресных вод. Различают трещинные, минерализованные, межпластовые, пресные. На территории более распространены межпластовые подземные воды.

В долине реки Чёрной отмечены межпластовые месторождения минерализованной воды Ласточка, имеющей гидрокарбонатно-калиево-кальциево-натриевый состав и являющихся одними из ценных в Приморье.

Источник минеральной воды «Ласточка» был открыт первыми переселенцами еще в конце 19 века. Название источника имеет свою историю. Издавна над этим местом кружили многочисленные стаи ласточек, которые гнездились неподалеку, чтобы передать другим, где лучше охотиться, просто говорили примету – "Ласточка".

Минеральная лечебно-столовая вода «Ласточка» применяется для профилактики и лечении заболеваний органов пищеварения, нарушений обмена веществ, болезней эндокринной, нервной и сердечно-сосудистой систем.