Реки Ямальского района:
Вары-Хадыта
Вода-Яха
Ер-Хадыта
Идюрцятатосё
Ляккатосё
Мордыяха
Нгарка-Салпадаяха
Нгарка-Тобантаркаяха
Нгарка-Харвотаяха
Нумтосё
Нюдя-Тинъяха
Паёседаяха
Пичугуйяха
Пякъяха (приток Оби)
Салпадаяха (приток Танлаваяхи)
Танлаваяха
Тарседаяха (приток Щучьей)
Тобантаркаяха
Тюуй-Харвотаяха
Хавыдама
Хадытаяха (приток Оби)
Хаманельская Обь
Ханавэйяха (приток Вары-Хадыты)
Хондеяха (река)
Хэяха (приток Щучьей)
Юрибей (впадает в Байдарацкую губу)
Ябта-Хадыта
Ямтинъяха
Янгутаяха
Ярапензя-Яха
В Ямальском районе насчитывается около 53 тыс. озер. Около 1000 озер имеют площадь зеркала от 1,0 до 10 км2, 36 озер – от 10 до 50 км2, 8 озер – от 50 до 100 км2. По числу самых крупных озер Ямальский район резко выделяется среди других районов округа. Большинство крупных водоемов образуют две компактные озерные группы – Центральноямальскую (Нёято – Ямбуто) и Южноямальскую (Верхнеюрибейскую, Ярато).
Озёра Ямальского района:
Луцато
Ямбуто (исток Мордыяхи)
Яррото 1-е
Яррото 2-е