Основные реки — Волга, Пахма, Которосль, Ить.

Реки:
Барыня
Березняк
Великая (приток Волги)
Вондель
Инишка
Ить
Каменка (приток Соньги)
Кисма
Когаша
Колба (приток Шепелюхи)
Кондра
Коптяиха
Которосль
Курбица
Матуговка
Митька
Нора (приток Волги)
Пажа (приток Вонделя)
Пажица
Пахма
Пегуша
Рога
Солоница (приток Волги)
Соньга
Сосновка (приток Пахмы)
Тоймина
Туношонка
Шакша (приток Туношонки)
Шепелюха
Шиголость
Ширинка

Родники Ярославского района:
Родник д. Большие Жарки
Родник д. Большое Макарово
Родник с. Васильевское
Родник д. Ватолино
Родник СНТ «Нефтяник-3» у с. Введенье
Родник база отдыха «Родник» («Янос») у с. Введенье
Родник базы отдыха «Прибрежное» у с. Введенье
Колодец с. Введенье
Родник д. Девятово
Родник д. Ершово
Родник «Гремиха» д. Карабиха
Родник п. Козьмодемьянск
Родник у пансионата «Ярославль» п. Красные Ткачи
Родник у п. Красные Ткачи
Родник с. Курба
Родник у п. Лесная Поляна
Родниковый колодец на ст. Лютово (ООПТ)
Родник у п. «Октябрь»
Родник д. Осташково
Родник у д. Пуплышево
Колодец у п. Садовый
Родник д. Седельницы
Родник у д. Сергеево
Родник д. Филинское