Лукояновский район находится на водоразделе четырех сравнительно больших рек: Алатыря, Мокши, Теши и Пьяны, две из которых в районе не протекают, но имеют свои притоки. Это реки Пьяна и Мокша.

По территории района протекают следующие реки:
водораздела реки Алатырь:

Вышовка,
Сухая Чеварда,
Мокрая Чеварда,
Санка,
Пандус (Пандуга),
Панзелка,
Ирса,
Сухая Ирса,
Печка,
Арзинка,
Мадаевка,
Ковач
ручей Меньшовка,
водораздела реки Мокша:
Уркат
Кутукс
водораздела реки Теша;
Хвощевка,
Ломовка,
Патерга,
Пойка,
Нарзимка (Хоруимка)
Пша (Потьма)
водораздела реки Пьяна:
Арька,
Ежать,
Пекшать,
Чека,
Воржа (Оржа),
Шнара,
Черезь,
Кочкоемка,
Аратка,
Пеля,
Пила,
Азалка,
Печенейка,
Колмонейка,
Сосновка

Большинство рек, протекающих в Лукояновском районе, небольшие, поэтому население для хозяйственных нужд вынуждено было создавать пруды. В настоящее время их в районе 122.