По району протекают реки:
Багана
Грязнуха (река, впадает в Куйбышевское водохранилище)
Изгарка
Кама
Каргалка
Малая Бахта
Малый Черемшан
Толкишка
Чебоксарка
Шентала
Шешма

Река Толкишка
статус: памятник природы.
Длина реки 49 км.
Площадь водосбора 527 кв. км.
Местоположение: Чистопольский район РТ. Исток в 3 км южнее с. Татарский Толкиш, устье у с. Свердловец Нижнекамского района РТ.
Характеристика объекта и его значение: Ширина реки, глубина, скорость течения незначительны. Толкишка принимает 11 притоков. Средний многолетний слой годового стока 115 мм. Слой стока половодья 109 мм. расход межени в устье 0,11 куб. м/с. Река маловодна. Имеет хозяйственное значение.