Водные ресурсы района представлены поверхностными и подземными водами. Речная сеть района представлена рекой Онон и ее притоками.
Реки Акшинского района: Онон, Урей, Акша, Акуя, Улача, Анкоикта, Джаргалантуй, Иля, Сарбалтуй, Верхняя Курулга, Халанда и др.
Озеро Халанда (фото) в отрогах Могойтуйского хребта, по левому борту долины р. Халанда. Халанда озеро с лечебными грязями, памятник природы. Длина 270 м, ширина 165 м. Используется населением для лечения и отдыха.
Озеро Делюн между падью Нижний Онкоек и падью Верхний Онкоек площадью 30,03 га.
Родники, источники Акшинского района:Родник «Глазной источник» у с. Нарасун
Автор фото Aleksey Petroff