Водные ресурсы района представлены реками Егорлык, Ташла и Мутнянка, которые используются для орошения, 30 искусственными водоёмами
для рыборазведения, из которых Новотроицкое водохранилище – крупнейшее. Оно используется для водоснабжения и на нем построена самая мощная на Северном Кавказе тепловая ГРЭС – Ставропольская.

В Изобильненском районе развита система орошения. Она представлена Правоегорлыкским и Левоегорлыкским каналами.

Новотроицкое водохранилище
Новотроицкое водохранилище создано в 1952 году на реке Егорлык. Площадь водной глади около 12 квадратных километров, максимальная глубина - 18 метров. Даже зимой водохранилище не замерзает. Побережье водоема необыкновенно красиво - это отличный вариант для отдыха в любое время года. Здесь более 20 баз и зон отдыха, каждая из которых по своему уникальна. На западном берегу расположен поселок Солнечнодольск, подавляющее число баз отдыха расположено на восточном побережье.

Гидрологический и гидрохимический режимы благоприятны для пресноводных рыб. Водоём не замерзает, так как в него сбрасываются тёплые воды ОАО "Ставропольская ГРЭС".

Состав ихтиофауны: сазан, серебряный карась, лещ, тарань, судак, голавль, сом, белый и пёстрый толстолобики, белый и чёрный амур, шемая, окунь. В численном отношении преобладают тарань, судак, окунь, серебряный карась и лещ.

Из водоёма наблюдаются нерестовые миграции ихтиофауны в реку Егорлык, покатные миграции ограничены рыбозащитными устройствами. Состояние стад промысловых рыб удовлетворительное. В последние годы с целью биологической очистки проводится усиленное зарыбление водоёма растительноядными видами рыб. Промысел в настоящее время на водохранилище не ведется, развито любительское рыболовство.

Родники, источники Изобильненского района:
Святой источник пророка Иоанна Предтечи и Крестителя Господня у с. Московское и п. Рыздвяный
Родник №1876 с. Московское, каптирован используется для водоснабжения населения
Святой источник первоверховных апостолов Петра и Павла х. Красная Балка
Родник «Золотой» у х. Красная Балка
Родник №4474 для водоснабжения с. Найденовское
Родник «Серебряный» у с. Подлужное
Родники «Гремучий» и «Рыданчик» каптированы и используются для водоснабжения села Подлужное, в округе села насчитывается более 20 больших и малых родников.
Никольский родник между п. Рыздвяный и х. Беляев 45.308705, 41.856842