Гидрология Заринского района представлена реками и несколькими озёрами. Гидросеть разветвленная и полностью принадлежит к бассейну верхней Оби. Самая крупная река — Чумыш, которая является третьей по длине рекой края, после Алея и Катуни. Ее длина от истока до впадения в Обь составляет 644 км. Площадь бассейна 23,9 тыс. км. Вода в Чумыше пресная, слегка мутная, пригодная для питья.

К крупным рекам района можно отнести Аламбай, Татарку, Тогул, Боровлянку, Уду. Менее крупные реки: Жуланиха, Мишиха, Хмелевка, Каменушка, Мостовая, Юрчиха, Гоношиха, Матвеевка, Сосновка. Течение рек в основном спокойное, в глубоких местах 2-3 м и быстрое при глубине 50-80 см. Вода в них прозрачная, пресная.

Кроме рек, по днищам логов протекают безымянные ручьи, берега которых заболочены. В долине Чумыша много пойменных озер, наиболее живописные из них: Григорьево, Котешное, Вяткино, Среднекрасиловская Курья, Хомутное и др.

Водоемы богаты различными видами рыб, здесь водятся щука, налим, стерлядь, окунь, лещ, карась, линь.

Река Аламбай является правым притоком Чумыша и берёт свое начало на западных склонах Салаира. В основном она протекает по таежной части, что оказывает прямое влияние на режим сезонных паводков. Наибольших отметок уровень воды в Аламбае отмечается в конце апреля и в начале мая, во время весеннего половодья. А вот осенне-летние паводки не столь выражены, что как раз и обуславливается повышенной лесистостью территорий, по которым река протекает.

На осевой части Салаирского кряжа начинает свой путь еще одна крупная река Заринского района — Тогул. Также как и Аламбай, она протекает по таежной местности, поэтому весенние паводки характеризуются более медленным подъёмом уровня воды, нежели в реке Чумыш.

Родники Заринского района:
Родник с. Голубцово 53.568574, 84.385161
Святой источник у с. Жуланиха
Родник с. Инюшово 53.639435, 84.355061
Родник с. Новомоношкино 53.621638, 84.508461
Святой источник у с. Среднекрасилово
Святой источник с. Хмелевка, здесь находится целебная голубая глина. В ближайших планах прихода благоустроить родник.
Родник Воронежский п. Шпагино 53.583817, 84.562193